Vers Une Modilisation Plus Rialiste Des Systhmes Biologiques (french Edition) [Paperback]

La plupart des fonctions ?nergie potentielle utilis?es pour simuler les syst?mes biologiques complexes ne traitent qu'implicitement la polarisation ?lectronique et ce, de fa?on tr?s incompl?te. Bien qu'efficaces pour un large ?ventail d'applications, ces champs de force atteignent rapidement leurs limites d?s lors que les effets de polarisation ?lectronique sont importants. Dans cette th?se, j'ai d?velopp? une approche bas?e sur la m?canique quantique pour obtenir des param?tres d'un champ de force polarisable ayant pour composantes des charges, des polarisabilit?s distribu?es d'ordre z?ro et un (isotrope) et un potentiel de van der Waals d?crit par une fonction de Buckingham. L'?nergie d'induction peut ?tre att?nu?e par une fonction de Tang et Toennies pour d?crire l'?nergie d'?change-induction. Cette approche a ?t? effectu?e avec succ?s pour l'interaction d'ions avec l'eau et le benz?ne mais aussi dans le cas d'un dim?re d'eau. Une premi?re ?tude des r?sultats en dynamique mol?culaire montre que les param?tres obtenus en phase gazeuse peuvent se transf?rer pour les simulations en phase condens?e.